Шитяков Сергей Васильевич
Prof., MD, PhD, DSc
Научные интересы
Методы и подходы в хемоинформатике:
 
  • Принципы и методы создания молекулярных баз данных в биомедицине и рациональном дизайне и открытии лекарств, включая различные составы, такие как циклодекстрины, в качестве векторов доставки лекарств вместе с молекулярным моделированием
 
 Отличительные особенности программы Возможность участия в междисциплинарных проектах на стыке биологии, химии, фармакологии и IT. Сотрудничество с иностранными коллегами из ведущих европейских университетов, регулярное участие в программах академической мобильности. Приобретение опыта в развитии и использовании уникального экспериментального оборудования для изучения протеин-лигандных взаимодействий.
 Перечень исследовательских проектов потенциального научного руководителя (участие/руководство)
  • Новые рН-чувствительные самоассемблирующиеся наноконтейнерные структуры на основе неорганических полимеров и молекулярных комплексов, руководитель проекта, участник, 2020-2021 гг.
  • Создание универсальной электрохимической сенсорной платформы для иммуноферментного определения содержания вируса SARS-CoV-2 в биологических жидкостях, участник, 2020-2023 гг.
 Перечень возможных тем для исследования
  • Молекулярное моделирование и моделирование биологически активных соединений для борьбы с COVID-19.
  • QSAR и QSPR моделирование с использованием AI-алгоритмов: молекулярный докинг, молекулярная динамика, квантовая механика и др.

Количество публикаций в журналах, индексируемых Web of Science или Scopus, за последние 5 лет (Publications in the last five years)

24
 Основные публикации
  1. Dutta K., Shityakov S., Zhu W., Khalifa I. High-risk meat and fish cooking methods of polycyclic aromatic hydrocarbons formation and its avoidance strategies//Food Control, 2022, Vol. 142, pp. 109253
  2. Shityakov S., Skorb E.V., Nosonovsky M. Topological bio-scaling analysis as a universal measure of protein folding//Royal Society Open Science, 2022, Vol. 9, No. 7, pp. 220160
  3. Bencurova E., Shityakov S., Schaack D., Kaltdorf M., Sarukhanyan E., Hilgarth A., Rath C., Montenegro S., Roth G., Lopez D., Dandekar T. Nanocellulose Composites as Smart Devices With Chassis, Light-Directed DNA Storage, Engineered Electronic Properties, and Chip Integration//Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2022, Vol. 10, pp. 869111
  4. El Azzouzi M., Azzaoui K., Warad I., Hammouti B., Shityakov S., Sabbahi R., Saoiabi S., Youssoufi M.H., Akartasse N., Jodeh S., Lamhamdi A., Zarrouk A. Moroccan, Mauritania, and senegalese gum Arabic variants as green corrosion inhibitors for mild steel in HCl: Weight loss, electrochemical, AFM and XPS studies//Journal of Molecular Liquids, 2022, Vol. 347, pp. 118354
  5. Fareed M., Ullah S., Aziz S., Johnsen T., Shityakov S. In-silico analysis of non-synonymous single nucleotide polymorphisms in human Beta-defensin type 1 gene reveals their impact on protein-ligand binding sites//Computational Biology and Chemistry, 2022, Vol. 98, pp. 107669
 Наиболее значимые результаты интеллектуальной деятельности

Shityakov S, Bencurova E, Seibel J, Dandekar T, 2017, Applications of nanocellulose composite materials for single-electron transistors, pH-changing colours, imprinting sensors, and energy storage devices, патент

 Требования, предъявляемые к аспиранту
  • Знать дисциплину «Молекулярная бионаука»
  • Знать основы фармацевтической химии
  • Знать основы рационального проектирования и разработки лекарственных средств
  • Владеть навыками программирования
 Направление подготовки, на которое будет приниматься аспирант
04.06.01 Химические науки
Специальность (профиль): Физическая химия
Специальность (профиль): Высокомолекулярные соединения
 
06.06.01 Биологические науки
Специальность (профиль): Биохимия
 
09.06.01 Информатика и вычислительная техника
Специальность (профиль): Искусственный интеллект и машинное обучение
Специальность (профиль): Автоматизация и управление технологическими процессами и производствами (промышленность)