Научные руководители
 |
Кошель Елена Ивановнакандидат биологических наук koshel@itmo.ru Структурное подразделение: лаборатория ДНК-наносенсорной диагностики Должность: заведующий лабораторией Структурное подразделение: химико-биологический кластер Должность: доцент (квалификационная категория "ординарный доцент") Структурное подразделение: химико-биологический кластер Должность: научный сотрудник Профиль: 03.02.07 - Генетика 03.01.04 - Биохимия 1.5.4. - Биохимия 1.5.7. - Генетика 2.2.8. - Методы и приборы контроля и диагностики материалов, изделий, веществ и природной среды 05.11.13 - Приборы и методы контроля природной среды, веществ, материалов и изделий Область интересов: Микробиология, программирование клеток, антибиотикорезистентность, фармацевтика, нанотехнологии, таргетная терапия, генная инженерия, генетика микроорганизмов, биопленки. Диагностика, микробиом, биоремедиация. Рабочий язык: Английский, Русский |
Публикации руководителя
| Выходные данные | Год | Индексирование в БД |
| Davidian A.G., Koshel E.I., Galkina S.A., Saifitdinova A.F., Gaginskaya E.R. Nucleolus Organizer Region Functioning in Chicken Growing Oocytes: A Revision of the Existing Views//Russian Journal of Developmental Biology, 2023, Vol. 54, No. 1, pp. 15-23 | 2023 | Web of Science |
| Rubel M.S., Shkodenko L.V., Gorbenko D.A., Solyanikova V.V., Maltzeva Y.I., Rubel A.A., Koshel E.I., Kolpashchikov D.M. Detection of multiplex NASBA RNA products using colorimetric split G quadruplex probes//Methods in Molecular Biology, 2023, Vol. 2709, pp. 287–298 | 2023 | Scopus, Web of Science |
| Pilipenko I., Murzova A., Savin A., Mohamed A., Vladimirova E., Koshel E., Shamova O., Kumacheva E. Dual-Function Hydrogel Dressings with a Dynamic Exchange of Iron Ions and an Antibiotic Drug for Treatment of Infected Wounds//ACS Applied Bio Materials, 2023, Vol. 6, No. 5, pp. 1896–1905 | 2023 | Scopus, Web of Science |
| Давидьян А.Г., Кошель Е.И., Галкина С.А., Сайфитдинова А.Ф., Гагинская Е.Р. Функционирование ядрышкового организатора в растущих ооцитах кур: ревизия существующих представлений // Онтогенез -2023. - Т. 54. - № 1. - С. 18-26 | 2023 | RSCI, ВАК, РИНЦ |
| Pozdnyakov I.R., Koshel E., Selyuk A.O., Sukhanova X.V. Transfer of culture of a bacterivorous protist Nuclearia thermophila to feeding on monoculture of Escherichia coli//Protistology, 2023, Vol. 17, No. 1, pp. 50-57 | 2023 | Scopus, ВАК, РИНЦ |
| Maltseva E.S., Nikolaeva V.O., Savin A.M., Dobryakov M.Y., Koshel E.I., Krivoshapkin P.V., Krivoshapkina E.F. Fluorescent Hybrid Material Based on Natural Spider Silk and Carbon Dots for Bioapplication//ACS Biomaterials Science and Engineering, 2022, Vol. 8, No. 8, pp. 3310-3319 | 2022 | Scopus, Web of Science |
| Volov A., Shkodenko L., Koshel E., Drozdov A.S. Bio-Inspired Surface Modification of Magnetite Nanoparticles with Dopamine Conjugates//Nanomaterials, 2022, Vol. 12, No. 13, pp. 2230 | 2022 | Scopus, Web of Science |
| Fakhardo A.F., Anastasova E.I., Makarov V., Ikonnikova E., Kulko E., Agadzhanian N., Yakunina M., Shkodenko L., Tsvetikova S., Toropko M., Koshel E., Zakharov M., Alexandrov G., Khuttunen O., Kulikov P., Burmistrov O., Vinogradov V., Prilepskii A. Heparin-coated iron oxide nanoparticles: application as a liver contrast agent, toxicity and pharmacokinetics//Journal of Materials Chemistry B, 2022, Vol. 10, No. 38, pp. 7797-7807 | 2022 | Scopus, Web of Science |
| Olunoiki E., Rehner J., Bischoff M., Koshel E., Vogt T., Reichrath J., Becker S.L. Characteristics of the Skin Microbiome in Selected Dermatological Conditions: A Narrative Review//Life, 2022, Vol. 12, No. 9, pp. 1420 | 2022 | Scopus, Web of Science |
| Protasiuk L.E., Serov N.S., Lokteva A.V., Kladko D.V., Koshel E.I., Vinogradov V.V. Mechano-bactericidal anisotropic particles for oral biofilm treatment//Journal of Materials Chemistry B, 2022, Vol. 10, No. 25, pp. 4867-4877 | 2022 | Scopus, Web of Science |
| Davidian A.G., Koshel E.I., Dyomin A.G., Galkina S.A., Saifitdinova A.F., Gaginskaya E.R. On some structural and evolutionary aspects of rDNA amplification in oogenesis of Trachemys scripta turtles//Cell and Tissue Research, 2021, Vol. 383, No. 2, pp. 853-864 | 2021 | Scopus, Web of Science |
| Alikina M., Shkodenko L., Kramarenko A., Chernyshov I., Belyaeva A., Gutsalova A., Krivoshapkina E., Koshel E., Vinogradov A. ClO2-Loaded Aerogels with Biocide Effect//ACS Applied Materials and Interfaces, 2021, Vol. 13, No. 41, pp. 49490–49499 | 2021 | Scopus, Web of Science |
| Falchevskaya A., Prilepskii A.Y., Tsvetikova S.A., Koshel E.I., Vinogradov V.V. Facile Synthesis of a Library of Hollow Metallic Particles through the Galvanic Replacement of Liquid Gallium//Chemistry of Materials, 2021, Vol. 33, No. 5, pp. 1571-1580 | 2021 | Scopus, Web of Science |
| Румянцева В.И., Кошель Е.И. Актуальная стратегия эрадикации сформированных биопленок при использовании магнитных наноструктур // Современные проблемы биохимии, генетики и биотехнологии: материалы III Всероссийской научной конференции с международным участием (Уфа, 21-23сентября 2021г.) -2021. - С. 174-178 | 2021 | РИНЦ |
| Rumyantceva V., Rumyantceva V., Andreeva Y., Tsvetikova S., Radaev A., Vishnevskaya M., Vinogradov V., Drozdov A.S., Koshel E. Magnetically controlled carbonate nanocomposite with ciprofloxacin for biofilm eradication//International Journal of Molecular Sciences, 2021, Vol. 22, No. 12, pp. 6187 | 2021 | Scopus, Web of Science |
| Буланцев Н.А., Комиссаров А.С., Кошель Е.И., Круглов Е.Е., Мякишева Ю.В., Кафтырева Л.А. Метагеномный анализ биоптатов толстой кишки пациентов с язвенным колитом // Гены и клетки [Genes and Cells] -2020. - Т. 15. - № S3. - С. 128 | 2020 | RSCI, ВАК, РИНЦ |
| Герцен А.В., Чаленко К.П., Недорезова Д.Д., Колпащиков Д.М., Кошель Е.И. Разработка стратегии борьбы с антибиотикорезистентными штаммами бактерий на основе использования ДНК - наномашин // Гены и клетки [Genes and Cells] -2020. - Т. 15. - № S3. - С. 184 | 2020 | RSCI, ВАК, РИНЦ |
| Chekini M., Krivoshapkina E.F., Shkodenko L., Koshel E.I., Shestovskaya M.V., Dukhinova M.S., Kheiri S., Khuu N., Kumacheva E. Nanocolloidal hydrogel with sensing and antibacterial activities governed by iron ion sequestration//Chemistry of Materials, 2020, Vol. 32, No. 23, pp. 10066-10075 | 2020 | Scopus, Web of Science |
| Vasilichin V.A., Tsymbal S.A., Fakhardo A.F., Anastasova E., Marchenko A.S., Shtil A., Vinogradov V.V., Koshel E. Effects of Metal Oxide Nanoparticles on Toll-Like Receptor mRNAs in Human Monocytes//Nanomaterials, 2020, Vol. 10, No. 1, pp. 127 | 2020 | Scopus, Web of Science |
| Tsvetikova S., Koshel E.I. Microbiota and cancer: host cellular mechanisms activated by gut microbial metabolites//International Journal of Medical Microbiology, 2020, Vol. 310, No. 4, pp. 151425 | 2020 | Scopus, Web of Science |
| Otinov G.D., Lokteva A.V., Petrova A.D., Zinchenko I.V., Isaeva M.V., Kovtunov E.A., Koshel E.I. Positive and Negative Effects of Metal Oxide Nanoparticles on Antibiotic Resistance Genes Transfer//Antibiotics, 2020, Vol. 9, No. 11, pp. 742 | 2020 | Scopus, Web of Science |
| Kovtunov E.A., Shkodenko L.A., Goncharova E.A., Nedorezova D.D., Sidorenko S., Koshel E.I., Kolpashchikov D.M. Towards Point of Care Diagnostics: Visual Detection of Meningitis Pathogens Directly from Cerebrospinal Fluid//ChemistrySelect, 2020, Vol. 5, No. 46, pp. 14572-14577 | 2020 | Scopus, Web of Science |
| Serov N.S., Darmoroz D., Lokteva A., Chernyshov I., Koshel E., Vinogradov V.V. One-pot synthesis of template-free hollow anisotropic CaCO 3 structures: towards inorganic shape-mimicking drug delivery systems//Chemical Communications, 2020, Vol. 56, No. 80, pp. 11969-11972 | 2020 | Scopus, Web of Science |
| Shkodenko L., Kassirov I.S., Koshel E.I. Metal Oxide Nanoparticles Against Bacterial Biofilms: Perspectives and Limitations//Microorganisms, 2020, Vol. 8, No. 10, pp. 1545 | 2020 | Scopus, Web of Science |
| Ulasevich S.A., Koshel E.I., Kassirov I.S., Brezhneva N.Y., Shkodenko L., Skorb E.V. Oscillating of physicochemical and biological properties of metal particles on their sonochemical treatment//Materials Science and Engineering C, 2020, Vol. 109, pp. 110458 | 2020 | Scopus, Web of Science |
| Chalenko K.P., Rotkevich M.S., Kolpashchikov D.M., Koshel E.I. Target selection protocol for DNA-machines development//BMC Bioinformatics, 2019, Vol. 20, No. Suppl.1(SI), pp. 516 | 2019 | Scopus, Web of Science |
| Volodkina V., Saifitdinova A., Kulak M., Koshel E.I., Galkina S., Gaginskaya E. Organization of zebra finch oocyte nucleus//Biopolymers and Cell, 2019, Vol. 35, No. 3, pp. 241-242 | 2019 | Scopus |
| Мисюрина М.А., Ковтунов Е.А., Шкоденко Л.А., Кошель Е.И. Разработка штамма Escherichia coli для доставки челночных векторов в эукариотические клетки // Живые системы - 2019: сборник научных статей -2019. - С. 191-193 | 2019 | |
| Rumyantceva V., Rumyantceva V., Koshel E., Vinogradov V. Biocide-conjugated magnetite nanoparticles as an advanced platform for biofilm treatment//Therapeutic Delivery, 2019, Vol. 10, No. 4, pp. 241-250 | 2019 | Scopus, Web of Science |
| Solomatina A.I., Baigildin V.A., Zhukovsky D.D., Krupenya D.V., Koshel E.I., Shcheslavskiy V.I., Tunik S., Chelushkin P.S. How to avoid protein aggregation to improve cellular uptake of albumin-based conjugates: towards the rational design of cell-penetrable phosphorescent probes//Colloid and Polymer Science, 2019, Vol. 297, No. 3, pp. 325-337 | 2019 | Scopus, Web of Science |
| Martakov I.S., Torlopov M., Krivoshapkina E.F., Kalikina P.A., Navrotskaya A.G., Koshel E.I., Galkina A., Demin V., Krivoshapkin P.V. Biotemplate synthesis of porous alumina fibers and filters with controlled structure and properties//Journal of the Taiwan Institute of Chemical Engineers, 2019, Vol. 95, pp. 281-289 | 2019 | Scopus, Web of Science |
| Solovev Y.V., Prilepskii A.Y., Krivoshapkina E.F., Fakhardo A.F., Bryushkova E.A., Kalikina P.A., Koshel E.I., Vinogradov V.V. Sol-gel derived boehmite nanostructures is a versatile nanoplatform for biomedical applications//Scientific Reports, 2019, Vol. 9, pp. 1176 | 2019 | Scopus, Web of Science |
| Мисюрина М.А., Кошель Е.И., Ковтунов Е.А., Шкоденко Л.А. Разаботка системы доставки челночных векторов в эукариотические клетки при помощи бактерий // Современные проблемы медицины и естественных наук: сборник статей Международной научной конференции (Йошкар-Ола, 15-19апреля 2019г.) -2019. - № 8. - С. 147 | 2019 | РИНЦ |
| Fakhardo A.F., Anastasova E.I., Gabdullina S.R., Solovyeva A.S., Saparova V.B., Chrishtop V.V., Koshevaya E.D., Krivoshapkina E.F., Krivoshapkin P.V., Kiselev G.O., Kalikina P.A., Koshel E.I., Shtil A.A., Vinogradov V.V. Toxicity Patterns of Clinically Relevant Metal Oxide Nanoparticles//ACS Applied Bio Materials, 2019, Vol. 2, No. 10, pp. 4427-4435 | 2019 | Scopus, Web of Science |
| Sopova J.V., Koshel E.I., Belashova T.A., Zadorsky S.P., Sergeeva A.V., Siniukova V.A., Shenfeld A.A., Velizhanina M.E., Volkov K.V., Nizhnikov A.A., Kachkin D.V., Gaginskaya E.R., Galkin A.P. RNA-binding protein FXR1 is presented in rat brain in amyloid form//Scientific Reports, 2019, Vol. 9, No. 1, pp. 18983 | 2019 | Scopus, Web of Science |
| Koshel E., Kassirov I.S., Rumiantceva V.I., Rumyantceva V.I., Ulasevich S.A., Andreeva I.I., Skorb E.V., Vinogradov V.V. Development of functional nanostructures effective against bacteria biofilms including multidrug resistant bacteria//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 605 | 2018 | RSCI, ВАК, РИНЦ |
| Rumyantceva V.I., Andreeva Y.I., Drozdov A.S., Vinogradov V.V., Koshel E.I. Development of magnetically controlled antibacterial complex effective against biofilms//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 616 | 2018 | RSCI, ВАК, РИНЦ |
| Komissarov A.S., Galkina S.A., Koshel E.I., Kulak M.M., Dyomin A.G., O'Brien S.J., Gaginskaya E.R., Saifitdinova A.F. New high copy tandem repeat in the content of the chicken W chromosome//Chromosoma, 2018, Vol. 127, No. 1, pp. 73-83 | 2018 | Scopus, Web of Science |
| Nikitina A.A., Ulasevich S.A., Kassirov I.S., Bryushkova E.A., Koshel E.I., Skorb E.V. Nanostructured Layer-by-Layer Polyelectrolyte Containers to Switch Biofilm Fluorescence//Bioconjugate Chemistry, 2018, Vol. 29, No. 11, pp. 3793-3799 | 2018 | Scopus, Web of Science |
| Kalikina P.A., Koshel E.I. Effect of metal oxide nanoparticles on the exchange of genetic material between bacteria//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 604 | 2018 | RSCI, ВАК, РИНЦ |
| Rumyantceva V.I., Koshel E.I. A study of the potential of spider silk use for the development of antibacterial drugs//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 617 | 2018 | RSCI, ВАК, РИНЦ |
| Kassirov I.S., Ulasevich S.A., Skorb E.V., Koshel E.I. Sonochemical nanostructuring of antibiotics is a new approach to increasing their effectivness against resistance strain//Инфекция и иммунитет = Infektsiya i immunitet [Russian Journal of infection and immunity], 2018, Vol. 8, No. 4(спецвыпуск), pp. 604 | 2018 | RSCI, ВАК, РИНЦ |
| Saifitdinova A.F., Koshel E.I., Galkina S., Vishnevskaya M. Celebrating the Jubilee of Elena Gaginskaya — the founder of the Lampbrushology School in Saint Petersburg University//Biological Communications, 2017, Vol. 62, No. 3, pp. 159-164 | 2017 | Scopus, ВАК, РИНЦ |
| Davidian A.G., Koshel E.I., Lavrova O.B., Dyomin A.G., Galkina S.A., Saifitdinova A.F., Gaginskaya E.R. Functional Features of the Nucleolar Organizer in Developing Oocytes of Juvenile Birds//Russian Journal of Developmental Biology, 2017, Vol. 48, No. 3, pp. 224–230 | 2017 | Scopus, Web of Science |
| Solomatina A.I., Chelushkin P.S., Krupenya D.V., Podkorytov I.S., Artamonova T.O., Sizov V.V., Melnikov A.S., Gurzhiy V.V., Koshel E.I., Shcheslavskiy V.I., Tunik S.P. Coordination to Imidazole Ring Switches On Phosphorescence of Platinum Cyclometalated Complexes: The Route to Selective Labeling of Peptides and Proteins via Histidine Residues//Bioconjugate Chemistry, 2017, Vol. 28, No. 2, pp. 426-437 | 2017 | Scopus, Web of Science |
| Dyomin A., Volodkina V., Galkina S., Saifitdinova A., Koshel E., Gaginskaya E. Evolution of ribosomal internal transcribed spacers in Deuterostomia//Molecular Phylogenetics and Evolution, 2017, Vol. 116, pp. 87-96 | 2017 | Scopus, Web of Science |
| Давидьян А.Г., Кошель Е.И., Лаврова О.Б., Демин А.Г., Галкина С.А., Сайфитдинова А.Ф., Гагинская Е.Р. Функциональные особенности ядрышкового организатора в растущих ооцитах неполовозрелых самок птиц // Онтогенез -2017. - Т. 48. - № 3. - С. 263–269 | 2017 | ВАК, РИНЦ |
| Koshel E.I., Chelushkin P.S., Melnikov A.S., Serdobintsev P.Y., Stolbovaia A.Y., Saifitdinova A.F., Shcheslavskiy V.I., Chernyavskiy O., Gaginskaya E.R., Koshevoy I.O., Tunik S.P. Lipophilic phosphorescent gold(I) clusters as selective probes for visualization of lipid droplets by two-photon microscopy//Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry, 2017, Vol. 332, pp. 122–130 | 2017 | Scopus, Web of Science |
| Galkina S., Fillon V., Saifitdinova A., Daks A., Kulak M., Dyomin A., Koshel E.I., Gaginskaya E.R. Chicken microchromosomes in the lampbrush phase: a cytogenetic description//Cytogenetic and Genome Research, 2017, Vol. 152, No. 1, pp. 46-54 | 2017 | Scopus, Web of Science |
| Koshel E., Galkina S., Saifitdinova A., Dyomin A., Deryusheva S., Gaginskaya E. Ribosomal RNA gene functioning in avian oogenesis//Cell and Tissue Research, 2016, Vol. 366, No. 3, pp. 533-542 | 2016 | Scopus, Web of Science |
| Dyomin A.G., Koshel E.I., Kiselev A.M., Saifitdinova A.F., Galkina S., Fukagawa T., Kostareva A.A., Gaginskaya E.R. Chicken rRNA Gene Cluster Structure//PLoS ONE, 2016, Vol. 11, No. 6, pp. e0157464 | 2016 | Scopus, Web of Science |
| Saifitdinova A., Komissarov A.S., Galkina S., Koshel E.I., Kulak M., Demin A., O'Brien S.J., Gaginskaya E. Sex Chromosome Specific Repeats in the Chicken Genome//Chromosome Research, 2016, Vol. 24, No. Suppl.1, pp. 1-48 | 2016 | Scopus, Web of Science |
| Dyomin A., Galkina S., Saifitdinova A., Koshel E.I., Gaginskaya E. Chicken ribosomal intergenetic spacer structure//Chromosome Research, 2016, Vol. 24, No. Suppl.1, pp. S40-S40 | 2016 | Scopus, Web of Science |
| Ерошенко Г.А., Кошель Е.И., Поршаков А.М., Князева Т.В., Краснов Я.М., Мокроусова Т.В., Новичкова Л.А., Анисимова Л.В. Характеристика энтомопаразитических нематод блох мелких грызунов // Проблемы особо опасных инфекций -2016. - Т. 3. - С. 32-37 | 2016 | ВАК, РИНЦ |
| Кошель Е.И., Ерошенко Г.А., Анисимова Л.В., Новичкова Л.А., Широков А.А., Буров А.М., Кузнецов О.С., Кутырев В.А. Оценка длительности сохранения штаммов Yersinia pestis в клетках почвенных амеб Acanthamoeba sp. в экспериментальных условиях // Проблемы особо опасных инфекций -2016. - Т. 2. - С. 69-74 | 2016 | ВАК, РИНЦ |
| Сайфитдинова А.Ф., Галкина С.А., Кошель Е.И., Гагинская Е.Р. Роль повторяющихся последовательностей в эволюции половых хромосом у птиц [The role of repetitive sequences in the evolution of sex chromosomes in birds] // Цитология [Tsitologiya] -2016. - Т. 58. - № 5. - С. 393–398 | 2016 | Scopus, ВАК, РИНЦ |
| Koshel E.I., Tomashenko O.A., Khlebnikov A.F., Gaginskaya E.R., Saifitdinova A.F., Tunik S.P. A new nuclear heterocyclic fluorescent dye–a promising tool for karyology and cytogenetics//Chromosome Research, 2016, Vol. 24, No. Suppl.1, pp. S29-S30 | 2016 | Scopus, Web of Science |
| Koshel' E.I., Anisimova L.V., Novichkova L.A., Vidyaeva N.A., Guseva N.P., Eroshenko G.A., Kutyrev V.V. A Study on the Taxonomy of Soil Amoebas from Caspian Plague Foci Based on an Analysis of Ribosomal Operon Sequences//Russian Journal of Genetics, 2015, Vol. 51, No. 1, pp. 33-38 | 2015 | Scopus, Web of Science |
| Кошель Е.И., Анисимова Л.В., Новичкова Л.А., Видяева Н.А., Гусева Н.П., Ерошенко Г.А., Кутырев В.В. Определение систематической принадлежности почвенных амеб из очагов чумы Прикаспия на основе анализа участков рибосомного оперона [A study on the taxonomy of soil amoebas from Caspian plague foci based on an analysis of ribosomal operon sequences] // Генетика [Genetika] -2015. - Т. 51. - № 1. - С. 39-45 | 2015 | Scopus, ВАК, РИНЦ |
| Koshel E.I., Aleshin V.V., Eroshenko G.A., Kutyrev V.V. Phylogenetic analysis of entomoparasitic nematodes, potential control agents of flea populations in natural foci of plague//BioMed Research International, 2014, Vol. 2014, pp. 135218 | 2014 | Scopus, Web of Science |